上药集团的前身是上海医药（集团）总公司，1996年10月由原上海医药管理局下属企业改制组建而成，2002年9月进一步改制成为多元投资的上海医药（集团）有限公司。公司总资产180·79亿元，净资产43·03亿元，其中，隶属中央企业工委管理的国家重点骨干企业集团——中国华源集团有限公司拥有40%股权，上海工业投资（集团）有限公司和上海华谊（集团）公司各拥有30%的股权。